Tijekom mnogih milijuna godina stijene su izrazito tektonski poremećene, o čemu svjedoče pukotinski i rasjedni sustavi koji se okršavanjem i erozijskim djelovanjem mora postupno proširuju. Tako je i nekadašnje erozijsko udubljenje u reljefu, danas poznato lokrumsko kupalište, u najmlađem geološkom dobu, kvartaru, ispunjeno morem.