U okviru projekta akronima ML-REPAIR koji je financiran putem INTERREG Italija – Hrvatska CBC Programa 2014-2020. - Smanjivanje i sprječavanje, integrirani pristup gospodarenju otpadom iz mora u Jadranu (REducing and Preventing, an integrated Approach to Marine Litter Management in the Adriatic Sea) znanstvenici Instituta za oceanografiju i ribarstvo, Split obavili su dvodnevno istraživanje otpada na morskom dnu u podmorju otoka Lokruma. Voditelj projektnih aktivnosti je dr.sc. Pero Tutman.
Za istraživanje su odabrane 4 podmorske lokacije - Skalica, Portoč, područje dviju špilja te područje od Rta Bačela prema Uvali pod Bor koje su različite po svojoj izloženosti vjetrovima i pritiscima turizma i pomorskog prometa kako bi se po analizi podataka utvrdilo koji od tih faktora i koliko doprinosi donosu otpada na morsko dno. Na navedenim lokalitetima otpad s morskog dna prikupljao se autonomnim ronjenjem po linijskim transektima dimenzija 25x4 m Također, obavljena je i sveobuhvatna analiza količine i sastava prikupljenog otpada.
Svojim aktivnostima ronioci su doprinijeli i ovogodišnjoj akciji čišćenja podmorja u okviru Zelene i Plave čistke koja je organizirana u suradnji s Gradom Dubrovnikom, Upravnim odjelom za urbanizam, prostorno planiranje i zaštitu okoliša.
U okviru ovog projekta, Otok Lokrum uvršten je kao ciljno područje ujedno i područje ekološke mreže Natura 2000 s ukupno 3 stanišna tipa u podmorju: naselja posidonije (Posidonion oceanicae), grebeni i preplavljene ili dijelom preplavljene morske špilje.
Obzirom na trenutni zakonodavni okvir, Javna ustanova Rezervat Lokrum upravlja isključivo otokom Lokrumom, a ne i podmorjem. Ipak, u tijeku je izrada uredbe kojom će biti definirana nadležnost upravljanja područjima ekološke mreže u moru te se očekuje da će Javna ustanova Rezervat Lokrum preuzeti upravljanje podmorjem u pojasu cca 150 m od obale.
Prirodne vrijednosti otoka Lokruma i podmorja čije jedinstvenu cjelinu pa stoga Javna ustanova Rezervat Lokrum kontinuirano uspostavlja suradnju sa stručnim i znanstvenim institucijama te u partnerstvu iznalazi načine kako bi doprinijela očuvanju i obale i podmorja otoka.